- Запушване на тръба поради нерaзградени органични и неорганични отпадъци.
- Твърде много пяна по повърхността на ямата, като е възможно преливане от шахтата, ако не се вземат своевременни мерки.
- Много утайка на дъното, което намалява полезният обем на ямата и увеличава нуждата от често изпомпване.
- Стените на ямата, при нетретиране с микроорганизми, се затлачват и хидропропоскливостта на почвата намалява.
- Лоши миризми причинени при застояване и бавно разграждане на органичните отпадаци. Миризми се отделят и от пяната образувала се при анаеробният процес по повърхността на ямата.
- Често пяната е знак, че на ямата и липсва нужната микрофлора, за да функционира оптимално.